El periódico dice que los barcos del rico propietario C.L. Magnus están siendo robados por el fantasma del pirata Barbarroja. Después de leer esto y visitar a Magnus, los chicos van en su bote para atraparlo, sin saber que pronto ellos son los que van a ser atrapados por el pirata y hechos prisioneros en su barco..Misterio a la orden Scoubidou Hol vagy Scooby Doo! Scooby-Doo merre vagy? Scooby-Doo Where Are You? Scooby-Doo Where Are You!