La Tercera Guerra Mundial (2099–2126) dejó medio planeta hecho mierda. Mientras los países se reconstruyen, aparecen nuevos poderes y grupos de humanos sobreviven en ciudades destruidas. La historia sigue a Deunan Knute y su compañero Briareos buscando la ciudad legendaria de Olympus. También conocida como: Appleseed - Alpha, Appleseed Α.