Después del Cuarto Impacto, Shinji, Asuka y Rei se quedan varados sin sus Evangelions. Encuentran refugio en un lugar donde todavía hay humanos en la Tierra destruida. Ahí viven una vida muy distinta a cuando eran pilotos. Pero el peligro no terminó. Un nuevo impacto se acerca, y este sí será el final de verdad. También conocida como: Rebuild of Evangelion: Final, Rebuild of Evangelion 3.0+1.0, Rebuild of Evangelion 3.0+1.0: Thrice Upon a Time, Evangelion: 3.0+1.01 Thrice Upon a Time, Evangelion.Final.