En el Tokio del futuro, la Mayor Motoko Kusanagi vive en un cuerpo robótico tras un accidente grave. Ella lidera la Sección 9, un grupo que combate delitos informáticos. Un hacker llamado El Marionetista aparece y empieza a controlar mentes con chips, dejando gente con recuerdos falsos. Kusanagi y su equipo lo persiguen por zonas llenas de luces y mercados ilegales de partes cibernéticas. Descubren que el tipo quiere unir todas las conciencias en una red gigante. Durante la cacería, la Mayor duda sobre si aún conserva algo humano dentro de su cuerpo de metal. La