La película trata de Asuna, una chica que pasa sus días sola escuchando música rara que sale de una radio de cristal que le dejó su papá. Un día, un monstruo la ataca y un chico misterioso llamado Shun la salva. Pero Shun desaparece y Asuna, junto a su profesor Morisaki, viaja a un lugar llamado Agartha para encontrarlo. Ahí descubre lo bonito y lo cruel que es el mundo, y también lo que es perder a alguien. También conocida como: Children Who Chase Lost Voices from Deep Below, Los niños que buscan voces perdidas.