Tomoro Tenma vive en un tiempo donde los pensamientos y emociones humanas, llamados e-Pulse, alimentan unas máquinas inteligentes llamadas Sapotama. Pero unos Digimon empiezan a aparecer desde esos aparatos y se alimentan del e-Pulse. La sociedad empieza a quebrarse. Cuando Gekkomon sale de su dispositivo, Tomoro se une a Glowing Dawn, un equipo secreto que investiga a los Digimon salvajes y la verdad oscura detrás de un sistema que funciona con emociones, pero también está corrupto por ellas.