La historia empieza en un salón de secundaria. El protagonista, Kyu, le dice al orientador que quiere ser detective. Así que aplica a la Escuela Dan, donde solo entran los más talentosos del país. Pasa el examen difícil para la clase "Q", que da el director, el legendario detective Dan Morihiko. Ahí conoce a Megumi, que tiene memoria fotográfica; Kintarou, descendiente de un famoso; Kazuma, un programador genio; y Ryu, un raro de la universidad. Los cinco trabajan juntos, compiten entre ellos y van hacia la graduación. También conocida como: Detective Academy Q.