La ciudad perdida de Atlantis aparece en la galaxia Pegaso. El Comando Stargate manda una expedición científica con la doctora Weir y el mayor Sheppard. Al llegar, no pueden contactar a la Tierra y, sin querer, despiertan a los Wraith, unos enemigos peligrosos que quieren devorarlos. Con ayuda de aliados locales como Teyla, el equipo explora su nuevo hogar mientras empieza una guerra para sobrevivir. También conocida como: Stargate: Atlantis, Stargåte: Atlåntis.