La historia muestra la vida de dos estudiantes del tercer año de un instituto en Hokkaidō, Chise y Shuji. Chise es una chica tranquila, tímida y algo torpe, que declara su amor a Shuji, un típico estudiante con grandes rasgos atléticos para su edad, el cual no es muy bueno manejando este tipo de relaciones. Todo parece ser una pequeña historia de amor, pero a la larga se convertira en una historia sobre el fin del mundo.